| 1 | Doğal ve yapay ekosistemlerin mikrobiyal ekolojisine giriş | [1], 1-55 |
| 2 | İzolasyon tekniklerinin prensipleri | [2], 22-43 |
| 3 | Kültüre bağlı izolasyon tekniklerine giriş | [2], 44-57 |
| 4 | Seçici besiyerleri | [3], 57-69 |
| 5 | Nükleik asitler ve DNA’nın özellikleri | [3], 69-88 |
| 6 | DNA ve RNA izolasyonu | [1], 76-85; [3], 88-156 |
| 7 | Nükleik asitlerin nitel ve nicel analizleri (agaroz jel electroforez); PCR | [1], 290-380 |
| 8 | Mikrobiyal çeşitliliğin değerlendirilmesi-I: Moleküler Klonlama ve Dizi Analizi | [3], 165-179 |
| 9 | Mikrobiyal çeşitliliğin değerlendirilmesi-II: DGGE | [4], 10-20 |
| 10 | Belirli mikrobiyal grupların miktarının belirlenmesi: FISH | [4], 30-37 |
| 11 | Deniz ve göl sularından alınan örneklerde metagenomik analizlerin yorumlanması | [4], 112-156 |
| 12 | Sediment ve topraktan alınan örneklerde metagenomik analizlerin yorumlanması | [4], 161-178 |
| 13 | Atıksu arıtma tesislerinden alınan örneklerde metagenomik analizlerin yorumlanması | [4],180-192 |
| 14 | Katı atık çürütücülerinden alınan örneklerde metagenomik analizlerin yorumlanması | [4],195-210 |