| Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi |  |
| Ayhan Şahenk Tarımsal Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Ağız ve Diş Sağlığı Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
Afet Eğitim ve Yönetimi Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Çevre Sorunları Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Endüstriyel Hammaddeler ve Yapı Malzemeleri Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Türk Dünyası Araştırmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Kadın, Aile ve Sosyal Politikalar Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Kazak Kültürü ve Eğitimi Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Nanoteknoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Prof. Dr. Turhan Nejat Veziroğlu Temiz Enerji Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Türkçe Öğretimi Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Niğde Yöresi Tarihi ve Kültürü Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi | |
| Bilgisayar Bilimleri Araştırma Uygulama Merkezi | |